邓飞
关于动植物育种数据分析中的相关问题，算法及程序代码，来问我吧！
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R语言遇到报错怎么办？经典回答
R语言遇到报错怎么办？经典回答「看看大神建议的解决方案：」❝「我推荐你清空R程序，然后重启一下 --hadley」❞1. 重启软件，能解决50%的问题多年的技术支持经验告诉我，当别人抛出一个报错时，你
2021 -05-28 经典 -
git | Windows下如何利用Linux的命令
各个遗传力的区分这些遗传力之所以有区分，是因为植物的一个基因型可以有多个观测值（比如多个重复，一年多点，多年多点），因此计算遗传力时会有区分。这里：单株遗传力个体遗传力家系遗传力小区遗传力单株遗传力
2021 -05-10 命令 -
利用R语言测试电脑的性能如何
利用R语言测试电脑的性能如何同事新配了一个电脑，想用R语言编写一个程序，看一下电脑性能如何，让我写个代码测试一下。我能怎么样，我也不懂如何测试电脑啊，那就计算一下矩阵的运算吧。因为我理解的电脑运行性能
2021 -05-10 电脑 -
GAPIT软件如何使用plink格式的数据进行GWAS的LMM模型分析
GAPIT软件支持的基因型格式为：hmp格式，plink数据转化为hmp格式，中间经过了很多路。现在提供另外一种解决方案，不用将plink数据转化为hmp格式，进行GWAS分析。1. GAPIT软件的
2021 -05-10 格式 -
GWAS问题答疑
昨天一个小伙伴给我写了封信，问我了几个GWAS的问题，我就回信说，答案可以写一下公众号了。这不，就来了。❝邓老师，您好，看了好多博文，学到好多，最近看一些GWAS原理相关的内容，有些疑惑。想请教一下。
2021 -05-10 问题 -
根据多年多点数据使用R语言计算遗传力和育种值
1. 背景之前写过一篇博客, 介绍领导安利我哔哩哔哩的故事, 介绍到我将我从YouTube上收集的关于混合线性模型, 关于GWAS, 关于GS, 关于农业数据分析相关的视频, 上传到了哔哩哔哩上面.
2021 -05-10 遗传力 -
PCA分析 | 不同品种的基因型数据绘制2D和3D的PCA图
PCA是降维的一种方法。很多软件可以分析PCA，这里介绍一下使用plink软件和R语言，进行PCA分析，并且使用ggplot2绘制2D和3D的PCA图。绘制后的图如下：2-D PCA图：图片解释，将每
2021 -04-01 基因型 绘制 -
plink软件cookbook
plink软件是我平时工作中最常用的软件之一，它的特点有两个：快功能强大快，真的是快，我用perl或者Python编写的代码运行需要50s，plink不到1s完成，在C语言面前，我掌握的语言是苍白的。
2021 -04-01 育种技术 软件技术 -
圈图 | 不同品种的基因型数据绘制PCA图和聚类分析图
PCA是降维的一种方法。本次再增加一下聚类的形式。很多软件可以分析PCA，这里介绍一下使用plink软件和R语言，进行PCA分析，并且使用ggplot2绘制2D和3D的PCA图。绘制后的图如下：2-D
2021 -04-01 圈图 基因型 绘制 -
方差分析多重比较可视化
本文主要是演示，看一下方差分析中，如果进行多重比较，如何对多重比较的结果可视化 1。1. 数据设置首先，载入butron.maize这个数据 2library(pacman)p_l
2021 -03-18 育种技术
