土壤微生物组
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#R语言绘制散点柱状图并添加显著性统计和标记#通过ggsignif对组间显著性进行统计和标注释,采用ggsignif可结合多种图形,如箱线图,柱状图等等进行显著性的统计和标记。#参考网站:https:
FIGURE 4 Relative influences of deterministic and stochastic assembly processes in shaping abundant
#R语言 | ggplot绘制柱状图添加散点、误差棒和虚线library(ggplot2)#数据获取#链接: 提取码:isqe#计算Nitgen metabolism在不同组间的丰度变化test_de
#R语言 | ggplot2绘制相关矩阵热图以及标注显著性#数据获取,可在百度网盘获取。#链接: 提取码:isqeotu_taxlibrary(ggplot2)library(reshape2)lib
#R语言 | ggplot绘制柱状图添加折线和误差棒#链接: 提取码:isqedf#构建测试数据框,计算"Microbes"的时间序列关系library(ggplot2)plot_
########### R语言 | 多分组柱状图+散点分布##链接: 提取码:isqenameclibrary(car)#计算标准差se_phyrownames(se_phy)mean#计算标准误se
#R语言计算微生物群落beta多样性otu_taxdat#链接: style=""#提取码:isqelibrary(vegan)#随机选择构建细菌,真菌和古菌数据集bacteria
引言 微生物参与着固氮、硝化、反硝化、厌氧氨氧化和异化硝酸盐还原为氨(DNRA)相关过程。除了固氮外,目前对珊瑚相关氮循环的理解主要依赖于遗传和基因组学研究,迄今为止很少有生物地球化学通量
应用案例Fig. 1 Soil microbial community composition and ecosystem functioning with progressive simplifif
######### R语言相关分析和渐变色系的使用#连续色系的使用能够使得画图对数值型因子进行可视化,如pH,年均温等等,目前已经是很多文献中常使用的一种方式,值得学习。小编在这里选取了比较喜欢的两种