找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
技术简介
该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
技术类型:-
应用行业:卫生和社会工作
技术简介
本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
成熟度:-
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
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该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
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应用行业:卫生和社会工作
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本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
成熟度:-
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技术简介
该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
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一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
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本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
技术简介
该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
技术类型:-
应用行业:卫生和社会工作
技术简介
本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
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本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
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该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
技术类型:-
应用行业:卫生和社会工作
技术简介
本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
成熟度:-
技术类型:-
应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
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本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
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该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
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应用行业:卫生和社会工作
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本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
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一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
成熟度:-
技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
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该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
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一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
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该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
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本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
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一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
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应用行业:卫生和社会工作
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一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
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应用行业:科学研究和技术服务业
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本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
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该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。
找到17项技术成果数据。
找技术 >鼠疫病原学和血清学检测技术在鼠疫监测和控制中的应用
成熟度:正在研发
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应用行业:制造业
技术简介
该项目通过对青海省喜马拉雅旱獭和青海田鼠鼠疫源地2001年~2013年间鼠疫监测和疫区处理等资料总结分析,基本明确青海省人间、动物间及媒介昆虫鼠疫发生特点和流行分布趋势,阐明鼠疫血清学和病原学检测技术的应用价值。首次报道了不同地区人群鼠疫血清学抗体分布水平,探讨青海省高危人群鼠疫血清流行病学特点和分布规律,首次用血清学方法明确不同地区藏系绵羊鼠疫特异性抗体的分布状况。通过研究确立反相血凝试验鼠疫特异性抗原的标准诊断方法。探讨了重组鼠疫菌素作为鼠疫诊断抗原的可行性,使鼠疫特异性抗体的诊断更加可靠;评价了胶体金层析和上转发光免疫层析等快速检测技术在人间鼠疫中的应用效果,为鼠疫血清学/病原学的早期和快速诊断提供了科学依据。该项目的实施提高了我国鼠疫临床诊断、应急处置的能力和水平,具有较大的社会效益和推广应用价值。成果达到国内领先水平。
基于AHP的鼠疫防治综合评价
成熟度:正在研发
技术类型:-
应用行业:卫生和社会工作
技术简介
本课题在国内首次应用层次分析法(AHP),对青海省鼠疫防控工作重要指标进行了评估,实现了由定性到定量的转变,使鼠疫防控工作更具科学性;通过动物鼠疫监测、宣传教育、风险评估、应急能力、治疗药物筛选五个方面,确立了鼠疫防治综合评价指标体系和各项评价指标的权重,建立了基于AHP的鼠疫防治综合评价模型。该方法的应用,对及时调整鼠疫防控对策、制定防治措施具有重要指导意义。成果达到国内领先水平。
新疆鼠疫自然疫源地的发现与研究
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技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究取得了以下成果:(1)新疆山地鼠疫疫源地分布及类型,鼠疫动物流行病学及鼠疫流行病学。(2)根据鼠疫自然疫源性三个基本因素--病原体、传播媒介、贮存宿主在自然界长期演化形成特殊生物群落的原理。(3)在12个县的山地发现了鼠疫疫源地。基本查明:新疆境内山地鼠疫疫源地的分布;鼠疫主要贮存宿主、媒介、鼠疫细菌的生态型;鼠疫动物流行病学基本规律;研究出鼠疫疫源地的类型特征。(4)根据研究成果及时提供了相应的防治鼠疫措施,从而在新疆范围内基本控制了人类鼠疫的发生和流行,取得了显著的社会-经济效益。
甘肃省鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组变异分析
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、任务来源 本项目为甘肃省卫生行业科研计划资助,项目编号GSWSKY-2017-21,资助金额3万元,本单位配套经费17万元。 二、研究目的与意义 鼠疫菌基因组中存在串联重复序列(VNTR)、差异区段(DFR)、单核苷酸突变(SNP)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)等特征。以前研究分别从基因组流行病学和生态流行病学的两个不同角度出发,使人们对于鼠疫菌进化历程和鼠疫在自然界的发生发展规律,有了比较明确的认识。但仍存在许多未知问题没有解决,其中尚没有将两者结合起来的研究报告,来揭示环境和宿主媒介变化对于鼠疫菌基因层面的影响。本项目从全基因组变异分析出发,以自然疫源地鼠疫菌为研究对象,获得准确的鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征和SNP突变遗传特征的本底资料。然后通过结合气候环境数据,将气候因素与鼠疫菌的全基因组内的遗传变异综合在一起,深入探讨鼠疫菌在局部地区受气候和宿主变化影响下的进化规律,阐明甘肃省鼠疫菌遗传进化特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,为研究甘肃省鼠疫疫源地鼠疫菌遗传进化规律奠定基础,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 三、主要论点与论据 1.基于SNP 建立邻接树(NJ),将55株鼠疫菌划分为2个生物型3 个群,分别是古典型(1.IN2、3.ANT)、中世纪型(2.MED)。其中37株菌属于1.IN2 群,是此次分析菌株的优势种群,占67.3%(37/55),14株菌属于3.ANT群,4株菌属于2.MED群。阿拉善黄鼠疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1962年,甘南高原疫源地鼠疫菌株的祖先时间大约在1963年,阿尔金山-祁连山鼠疫疫源地菌株主要存在1.IN2和3.ANT两种群,两群的分化时间可能为1963年,两群菌株从1964年流行后,一直持续流行至今。 2.肃北县31株鼠疫菌继续可分为三个群,分别为GROUP1、GROUP2和GROUP3,其中GROUP1菌株(6株)均为3.ANT型,而GROUP2和GROUP3菌株(25株)均为1.IN2型。GROUP2群菌株继续分为2个亚群, GROUP2.1群菌株主要集中在鱼儿红地区,GROUP2.2群内菌株依据分离地点细化不同分支,为该地区的主要类群。GROUP3群菌株也可以分成2个群,为GROUP3.1和GROUP3.2。GROUP3.1群内菌株来自不同分离地点,GROUP3.2群菌株主要集中在肃北县党城湾镇马场,且为鼠疫流行的主要类群。31株鼠疫菌SNP突变主要集中在基因YPO0966、YPO0970、YPO0971、YPO1007和YPO1471、YPO1472、YPO1473这两段基因区域。但是基因上SNP突变频率不符合二项分布,说明肃北县基因组没有存在明显突变热区。 3.阿拉善黄鼠疫源地的CRISPR基因簇为Cb2,基因型为1型。Ca7′为甘南高原疫源地的主要基因簇,基因型为22′型。阿尔金山-祁连山北麓东段区鼠疫疫源地存在Ca7、Ca35′、CaΔ5′三种主要类群,此块疫源地地理分布上从西向东分别属于阿尔金山疫源地(阿克塞哈萨克族自治县)、大雪山疫源地(肃北蒙古族自治县和玉门市)和祁连山北麓东段区(肃南裕固族自治县),CRISPR能够从地理分布区分鼠疫菌株。 4.通过聚类图可以看出,阿拉善黄鼠疫源地大部分菌株聚集为一群,1株聚集在肃南县马蹄乡群,1株聚集在肃北县党城湾镇群。阿克塞县鼠疫菌株主要分为2个群,分别集中在阿克塞县红柳湾镇当金山群和加尔乌宗村群。肃北县鼠疫菌主要分为3个群,分别为党城湾镇马场群、党城湾镇群和鱼儿红群。玉门市菌株主要聚集在肃北县鱼儿红群内。夏河县菌株单独成为一群。肃南县菌株主要分为3个群,分别为大河乡群、马蹄乡群和康乐乡群。 四、创见与创新 1.建立了甘肃省鼠疫菌VNTR位点重复数、CRISPR位点特征、SNP突变等基因组的遗传特征,为以后鼠疫菌株的追踪溯源提供技术资料,也为今后开展鼠疫菌遗传突变监测提供依据。 2.在种群结构分析中采用极大似然和贝叶斯统计建树的方法构建系统发育树。 3.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供了可借鉴的模式,也为鼠疫监控和预警工作的优化提供理论依据。 五、社会经济效益、存在问题 1.建立了甘肃鼠疫菌基因组多态性数据库,明确了各疫源县鼠疫菌基因型,为人间疫情分子生物学溯源提供了科学依据。在我省人间疫情流行病学溯源中发挥了定性作用,提高突发疫情应急处置水平。 2.探索了鼠疫菌在局部地区的进化特征,为细菌种群进化、流行病学与生态学的跨学科综合研究提供借鉴模式,也为鼠疫监测和预警工作的优化提供理论依据。
甘肃鼠疫主要宿主动物致病耶尔森菌感染状况调查和基因演变规律研究
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应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、 课题来源与背景 本项目为2015年立项的国家自然科学基金,项目编号81560541,资助经费48万元。 二、研究的目的和意义 耶尔森菌属属于肠杆菌科,包括11个菌种,其中对人和动物具有致病性的有3种:鼠疫耶尔森菌、小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌[1]。关于3种致病性耶尔森菌在自然界是否存在替代或拮抗关系, 鼠疫的流行、静息、保存问题是当前学术关心和探讨的热点。有学者认为由于3种致病性耶尔森菌具有共同位于毒力质粒上的的V抗原,感染某一种致病性耶尔森菌后会获得保护性免疫,当再次暴露在其他种致病性耶尔森菌污染的环境中不会发生感染[8]。日本学者认为第3次世界鼠疫大流行波及到日本但没有造成大的流行, 很可能与假结核、小肠结肠炎菌在日本广泛分布有关。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,各鼠疫疫源县动物鼠疫呈现不同流行状态,有的疫源地动物间鼠疫流行猛烈,不时波及人间,有的疫源地一直处于静息状态,这是否与疫源地主要宿主动物感染小肠结肠炎菌、假结核菌有关,因此,本项目通过本研究通过甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病耶尔森菌感染状况调查及其基因演化规律研究,旨在了解甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森氏菌是否存在替代或拮抗或协同作用,从流行病学和分子生物学角度进行探讨,进一步认识甘肃鼠疫发生和流行规律,为新时期甘肃鼠疫防控提供科学依据。 三、 主要论点与论据 1.甘南高原喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫主要宿主动物大仓鼠、短尾藏仓鼠、大耳鼠兔等啮齿动物小肠结肠炎耶尔森菌检菌率高于喜马拉雅旱獭。 2.处于“静息”的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的小肠结肠炎耶尔森菌的地点与其动物间鼠疫活跃时代检出鼠疫菌的地点基本一致。 3.处于相对活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内未检出的小肠结肠炎耶尔森菌,检出非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 4.处于非常活跃的鼠疫疫源地主要宿主动物肠道内检出的小肠结肠炎耶尔森菌、非致病性耶尔森菌的地点与检出鼠疫菌的地点有重叠。 5.鼠疫主要宿主动物肠道内分离出其他菌株。 阿拉善黄鼠疫源地共采集各类啮齿动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为487、494份(主要宿主动物阿拉善黄鼠423、430份,其他动物64、64份),喜马拉雅旱獭疫源地共采集各类动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别为2207、2212份(主要宿主动物喜马拉雅旱獭2174、2179份,其他动物33、33份),分别分离出小肠结肠炎耶尔森菌9、18株,弗氏耶尔森菌1、1株,克氏耶尔森菌3、2株,假结核耶尔森菌1、0株,鲁氏耶尔森菌1、0株,中间耶尔森菌6、6株,奥氏耶尔森0、1株,Y.massiliensis2、0株,鼠疫菌96株;检出的27株小肠结肠炎耶尔森菌全部为非致病性菌株。鼠疫主要宿主动物咽拭子或舌根部标本、回盲肠及内容物标本分别分离出478、338株其他菌株,隶属于14属22种; 鼠疫间接血凝试验方法(IHA)检测阿拉善黄鼠血清312份,喜马拉雅旱獭血清3438份,鼠疫F1抗体阳性69份,阳性率2.00%;犬血清591份,鼠疫F1抗体阳性65份,阳性率11.00%。 阿拉善黄鼠疫源地未能从阿拉善黄鼠体内分离到携带致病性耶尔森菌,无法从病原学角度解释该疫源地动物间鼠疫流行状态,但从多年监测分析该疫源地核心地带动物间鼠疫呈现间断性微弱流行,可能与疫源地动物、媒介、植被、土壤、气象等综合因素相关。喜马拉雅旱獭疫源地未能从喜马拉雅旱獭体内分离到致病性耶尔森菌,无法从致病性耶尔森菌间存在拮抗作用这一学说来解释该疫源地动物鼠疫流行状态,但这些非致病性耶尔森菌菌株的分离为研究非致病性耶尔森菌与鼠疫菌关系提供了资源,也为进一步研究该疫源地鼠疫菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。处于动物间鼠疫疫情活跃的地区分离鼠疫菌占绝对优势,是否存在鼠疫菌对其他耶尔森菌拮抗作用,这需要做进一步的研究。 四、 创见和创新 全面了解甘肃鼠疫疫源地主要宿主动物3种致病性耶尔森菌感染状况,分析3种致病性耶尔森菌在鼠疫疫源地相互作用关系,进一步认识鼠疫发生和流行规律;从分子生物学角度探讨甘肃鼠疫疫源地3种致病性耶尔森菌同源、进化和演变规律,为甘肃鼠疫防控提供科学依据。 五、社会经济效益,存在问题 本项目目前虽然未对鼠疫主要宿主动物肠道内分离出的非致病性耶尔森菌和其他菌株作详细分析,但是为进一步系统分析主要宿主动物携带耶尔森菌动态变化,探索研究分离耶尔森菌与鼠疫菌间的相关性,对鼠疫流行的影响,为进一步阐明各疫源地动物鼠疫出现不同流行态势提供科学依据;同时,为开展鼠疫主要宿主动物喜马拉雅旱獭肠道菌谱系调查研究提供保障。
甘肃鼠疫自然疫源地危害性评估及防控对策研究
成熟度:-
技术类型:-
应用行业:卫生和社会工作
技术简介
一、课题来源与背景 本项目为甘肃省卫生行业科研计划管理项目,项目编号GWGL2014-72,无资助经费,单位自筹10万元。 二、研究的目的和意义 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的一种传染性强,传播速度快、病死率高的烈性传染病。甘肃是鼠疫流行比较严重的省份之一,自1959年开始成立鼠疫疫源性调查队,在全省范围内开展鼠疫自然疫源地调查,目前证实我省存在两种类型鼠疫自然疫源地,即青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,疫源地面积占全省面积的19%。80年代以来在开展以监测为主的综合防控的同时,开展宿主、媒介、病原及流行病学方面的研究,基本掌握了我省鼠疫疫源地动物鼠疫流行规律和人间鼠疫感染主要方式。然而,近几年来,随着全球气温变暖、退牧还草项目实施,鼠疫自然疫源地气温、植被、降水量等指标发生变化,影响了鼠疫动物宿主媒介数量和活动及动物间鼠疫流行强度和范围改变。同时伴随经济快速发展、旅游业的兴起,大型工程项目的建设,进入活动疫区从事各种副业、狩猎和旅游人员急剧增加,与染疫动物接触频繁,人间疫情呈上升趋势。2000年以来,共发生11起人间疫情,确诊11例,其中9例死亡,仅2014年三个月内连续发生3起人间鼠疫,造成很大的社会影响及巨大的经济损失。2017年在喜马拉雅旱獭入蛰的情况下,又发生了1起人间鼠疫疫情,2019年国庆前夕,也发生了1起人间鼠疫疫情。因此重新评估甘肃鼠疫自然疫源地地区对人类和社会经济的危害性,提出适合新形势下鼠疫的防控对策十分必要。 三、主要论点与依据 1.甘肃省还有大量喜马拉雅旱獭分布区域,如甘南的玛曲、临潭、迭部等县,肃州区和山丹与内蒙接壤的北山都有鼠疫宿主动物喜马拉雅旱獭分布,还存在潜在鼠疫疫源性。 2.喜马拉雅旱獭疫源地及阿拉善黄鼠疫源地内动物鼠疫的流行与喜马拉雅旱獭、阿拉善黄鼠密度、体外寄生蚤蚤指数和染蚤率的变化有关。 3.甘肃两类鼠疫自然疫源地动物鼠疫发生和流行各不相同,需要因地制宜,规范鼠疫监测工作,加强鼠疫应急演练及健康教育工作,做到依法科学有效防控鼠疫。 4.尽管我省鼠防工作取得了显著成效,但与其他发达省份相比,甘肃省的鼠疫防控服务能力还比较落后,鼠疫防控体系还不够完善,具体措施落实不力,因此,有必要总结梳理我省鼠防经验和存在短板,进一步强化措施,有效防止人间鼠疫发生和流行。在做好本地鼠疫防控工作的同时,认真梳理和分析“一带一路”建设给鼠疫防控带来的新问题,用全球视角看新形势下的鼠防工作,结合当地实际,不断创新鼠疫综合防控措施,不断提高自身鼠疫防控能力。加强动物鼠疫监测、预测预警,人间鼠疫快速识别等方面的培训,加快知识更新,加强应急演练,加大物资和技术储备,不断提升应对较大鼠疫疫情甚至跨国境、跨区域鼠疫应急处置能力,采取因地制宜,分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。 四、创见和创新 与国内同类研究比较,本项目一是建立宿主动物潜在分布预测模型,甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫主要宿主动物分布范围界定,并对肃北马鬃山地区大沙鼠鼠疫疫源性进行调查。二是建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围。三是引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫耶尔森菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析。四是引进鼠疫风险评估工具,对甘肃鼠疫自然疫源地鼠疫风险进行评估。通过风险评估工具的应用,提出该工具在应用过程中存在的不足之处。五是提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策。 五、社会经济效益、存在问题 该项目采用3S技术,建立宿主动物潜在分布预测模型,通过AUC等评价指标进行验证,对我省旱獭鼠疫自然疫源分布范围进行界定,为下一步调查甘肃存在潜在旱獭鼠疫自然疫源地分布提供技术支持。引进风险评估工具,提升了我省鼠疫科研技术进步,推动了鼠疫防控乃至传染病防控事业发展;建立甘肃鼠疫信息库,分析甘肃疫源地宿主动物及寄生蚤数量变化和季节消长变化,分析甘肃疫源地动物鼠疫发生和流行范围,引进DFR分型、CRISPR分型、MLVA分型等鼠疫分子生物学技术,对代表性鼠疫菌进行基因分型,结合流行病学调查,对甘肃省人间鼠疫流行病学特征和影响因素进行全面分析,提出适合新时期、新形势下甘肃鼠疫防控对策,便于对各疫源地进行分类管理,分类指导,制订适宜的防控策略,有效防止人间鼠疫发生和流行,切实保障人民群众健康和生命,维护社会安全稳定,促进经济快速发展等方面具有重要作用意义。
内蒙古鼠疫自然疫源地的现状及发展趋势的预测
成熟度:-
技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
本研究是根据八十年代后世界范围内鼠疫自然疫源地从保存状态进入流行状态的新形势而立题的。旨在及时掌握内蒙鼠疫疫源地动向,对人的威胁性,为确立新时期防制鼠疫策略提供理论依据和信息。运用现代生态系的分析方法,经过近十年的研究取得如下成果:按新的科学的方法重新划定了各型疫源地的界限和范围;全面分析了疫源地的现状,预测了未来的发展趋势;揭示了当代条件下人感染鼠疫的主要途径;恰当估计了当前鼠疫对人的威胁性。依上述理论形成了新时期防制鼠疫的策略和措施;依法管理和分类指导;突出宣教和监测;从实际出发因地制宜开展鼠疫动物病控制工作;动物鼠疫区处理原则视对人的威胁程度而定;预防接种是非常重要的措施。
四川省鼠疫及其自然疫源地的发现
成熟度:-
技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该研究运用现场流行病学调查和实验室方法,以在自然界野生动物等材料中检获鼠疫杆菌为指标,对四川省境鼠疫及其自然疫源地进行明确判定。其技术关键在于有效地调查收集与鼠疫密切相关可检材料进行细菌分离,检出活体鼠疫杆菌并鉴定确认。结果表明,在石渠县青海田鼠中分离检获鼠疫杆菌54株,主宰了鼠疫在当地动物间流行,由此发现该地存在鼠疫疫源地。本发现揭示的四川省鼠疫及其自然疫源地存在事实,填补了中国疫源地空间分布上在四川省区域的空白,是四川对鼠疫的首次确认。对全国鼠防布局和该省鼠防对策都提供了宝贵科学依据,并由此开启和推动对四川区域鼠疫及其自然疫源地的深入研究,以提高鼠防水平,保护人民健康。
河北省鼠疫自然疫源地生态研究
成熟度:-
技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
该项研究累积了数十年的工作,获取并检验了数量巨大的啮齿动物与蚤类标本,首次围绕鼠疫自然疫源地、宿主动物、媒介蚤类、鼠疫菌,发现了鼠疫自然疫源地的存在,搞清河北省鼠疫自然疫源地的分布范围、自然概况,查清了疫源地内鼠疫主要宿主动物,并掌握了长爪沙鼠的生活习性、生态特点,查清了媒介蚤类的种类、分布、构成、数量季节消长,确定了鼠疫菌的菌型及动物间鼠疫的流行特征,发现了经过长期保存的鼠疫菌,在培养过程中菌体、菌落、毒力变异的现象,提出了河北省的鼠疫控制目标是“鼠间鼠疫不下坝,人间鼠疫不发生”。成果达到国内领先水平。
广西鼠疫历史疫源地调查与防治对策研究
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技术类型:-
应用行业:科学研究和技术服务业
技术简介
通过调查研究,对广西鼠疫流行的时间、空间及强度有了较为全面的认识。广西鼠疫发生流行的最早时间可以追溯到宋绍兴五年(1135年),比过去一直认定的1866年提前了731年,充分表明广西鼠疫由来已久,早已潜伏着鼠疫疫源,即使在没有异地传入的条件下也可以复燃而造成流行。传染病流行的空间界限不像地方病或化学环境因素所致的疾病那样清晰与恒定,这次调查所认定的广西鼠疫流行区域(历史疫区)只能是在空间上勾画出一个大致的轮廓。在长达865年的流行过程中,共有63个市县发生了130年次的鼠疫流行,比过去所说的46个市县63年次流行更为广泛,也充分说明广西鼠疫一是个广为传播、反复流行、危害严重的传染病。更深刻地体会到疫情“三报”(报自毙鼠,报疑似鼠疫患者,报不明原因的发热急死病例)的关键作用和重要意义。疫情监测质量关联着疫情能否及时发现并采取有效的控制措施,影响着流行范围、强度及防制效果等一系列问题。尤其是该课题在自然疫源地研究方面取得了突破性的进展,更全面科学地认识广西鼠疫历史情况,疫源状态及疫情危险区域,为全面加强防治提供科学依据。