本研究是针对甲型H1N1流感大流行防控工作的需要及时开展的研究项目。本研究将现场流行病学研究技术、分子诊断技术、遗传进化分析技术及耐药检测等技术进行了全面的集成与应用。整合甲型H1N1流感防控技术研究成果，科学制定防控技术措施应用于甲型H1N1流感大流行防控实践。其创新性如下：1.率先建立覆盖全省立体式完善的甲型H1N1流感监测网络，及时掌握甲型H1N1流感的流行特征。2.首次提出分区域防控的策略调整，轻症病例居家治疗和密切接触者居家隔离等防控技术措施，这些措施在广东的防控工作中发挥了关键的作用，为全国的防控策略措施调整提供了成功的范例。3.率先建立省级耐药监测体系，在国内最早使用神经氨酸酶抑制剂化学荧光技术对流感分离毒株进行耐药检测，并结合测序技术发现耐药变异位点。阐明了基因重组可导致双重耐药株的产生。在毒株变异等方面有重要的发现。为国家提供大量H1N1流感病毒株，为疫苗株的筛选和丰富流感病毒生物信息库做出巨大贡献。4.率先建立甲型H1N1流感大流行预警分析指标，将症状监测与实验室检测结果有机结合，及时提供疾病发病变化趋势。该指标简单、实用、稳定，易于推广，对判断流感大流行的态势具有重要作用。5.开展大规模人群血清流行病学调查研究，首次科学评估广东省人群甲型H1N1流感的感染状况。对合理调配医疗资源、制定人群免疫策略具有深远的意义。本研究设计科学，技术成熟，在国家、广东省及市级甲流防控机构、部门、地区得到广泛应用,减少疾病对社会秩序的冲击，节约卫生资源，降低了人群感染率，具有重大的社会效益。项目研究对新发传染病防控创新性提出具有科学性的技术措施，提供了丰富的科学数据和实践经验，其成果应用解决了重大公共卫生问题，对国家社会经济发展提供重要保障。本研究出版两部专著，发表32篇论文，其中SCI论文6篇。本研究具有广泛的应用前景，其应用和推广将具有巨大的经济和社会效益。