该项目针对青藏高原区域生态环境脆弱、气候变化敏感、生态环境问题复杂、经济社会发展落后、民族文化多样等特点，历时3年，以制定区域生态环境保护综合规划为目的，将生态评估基础研究与国家环境管理决策应用研究有机结合，全面开展了青藏高原生态环境和经济社会现状及情景分析、生态功能评估与保护、环境与经济协调发展空间格局分析、重点流域水污染防治、环境管理及能力建设、青藏铁路对沿线地区生态环境影响分析、农村及农牧业环境保护、重大水资源开发利用工程环境影响等重要领域的深入研究。并在该基础上，开展并完成了区域生态环境保护综合规划编制研究。该项目取得如下创新性研究成果和技术经济指标：(1)系统开展了青藏高原区域生态环境评估，集成建立了生态脆弱区和生态屏障区生态综合评估的技术方法，科学界定了青藏高原区域范围；(2)建立了区域综合性环境功能区划技术方法，研究制定了中国首个区域尺度的环境功能区划；(3)将青藏高原区域作为完整的经济－社会－环境复合生态系统，提出了区域中长期生态环境保护总体战略和实施路径；(4)创新性建立了以生态补偿为核心的区域生态环境保护政策体系；(5)建立了可长期服务于青藏高原区域生态环境管理的信息系统。研究成果对中国生态脆弱区和生态屏障区中长期生态环境保护综合性规划研究编制具有重要借鉴和示范作用。研究成果已经得到直接应用，产生广泛的社会影响。《青藏高原区域生态建设与环境保护规划》(国发[2011]10号)已于2011年5月1日由国务院印发实施。青藏高原6省(自治区)国民经济和社会发展、环境保护等有关规划、计划、方案研究制定均应用了项目有关成果。随着规划逐步实施，所产生的环境、经济、社会效益将逐步显现。